กรมพัฒนาการแพทย์แผนไทยและการแพทย์ทางเลือก โดย สำนักวิชาการ ได้ดำเนิน การจัดทำ รายงานการสาธารณสุขไทย ด้านการแพทย์แผนไทย การแพทย์พื้นบ้าน และ การแพทย์ทางเลือก (Thai Traditional and Alternative Health Profile) นับเป็น รายงานการสาธารณสุขไทยด้านการแพทย์แผนไทย การแพทย์พื้นบ้าน และการแพทย์ทางเลือก ฉบับแรก ซึ่งได้ผ่านกระบวนการมีส่วนร่วมจากผู้เชี่ยวชาญและผู้แทนหน่วยงานที่รับผิดชอบ ข้อมูลที่เกี่ยวข้อง เพื่อให้รายงานดังกล่าวเป็นประโยชน์ในการเป็นข้อมูลกำหนดนโยบาย และ ทิศทางของการพัฒนางานด้านการแพทย์แผนไทย การแพทย์พื้นบ้าน และการแพทย์ทางเลือก

การจัดทำรายงานการสาธารณสุขไทย ด้านการแพทย์แผนไทย การแพทย์พื้นบ้าน และ การแพทย์ทางเลือก พ.ศ. 2552 - 2553 นี้ มีเรื่องเด่นที่มีความสำคัญรวม 9 เรื่อง คือ  1. ประวัติศาสตร์การพัฒนาการแพทย์แผนไทยฯ 2. นโยบายและยุทธศาสตร์ด้านการแพทย์แผนไทยฯ 3. ระบบบริการการแพทย์แผนไทย การแพทย์พื้นบ้าน และการแพทย์ทางเลือก 4. สถานการณ์ยาแผนไทย 5. ภูมิปัญญาการแพทย์แผนไทย และการแพทย์พื้นบ้าน 6. สถานการณ์การขับเคลื่อนภูมิปัญญาท้องถิ่นด้านสุขภาพการแพทย์แผนไทย การแพทย์พื้นบ้าน และการแพทย์ทางเลือกผ่านกระบวนการสมัชชาสุขภาพแห่งชาติ 7. การคุ้มครองภูมิปัญญาด้านการแพทย์พื้นบ้าน การแพทย์แผนไทย 8. สถานภาพงานวิจัยภูมิปัญญาท้องถิ่นด้านสุขภาพ การแพทย์แผนไทย การแพทย์ พื้นบ้าน และการแพทย์ทางเลือก 9. ทิศทางการพัฒนาการแพทย์แผนไทย และการแพทย์พื้นบ้าน